东京湾的夜色渐浓，“远航号”货轮的灯光如孤星般在海面上移动，正缓缓驶离近海海域。米花市情报中心内，大屏幕被实时监控画面分割成多个区域：左侧是货轮的卫星定位轨迹，一条红色线路清晰标注着其驶向南美的航线；右侧是货轮甲板、驾驶室的实时监控画面，由提前潜入的卧底人员秘密传回；下方则是拦截团队的部署动态，所有单位均已进入待命状态。
“‘远航号’已驶离东京湾管控区域，目前航行速度12节，航向稳定。”安室透盯着屏幕上的航迹数据，向众人汇报，“卧底传回消息，货轮甲板下方的三号货舱守卫最为严密，推测深海矿石与乌丸莲耶的转移设备都藏匿在此。驾驶室共有5名船员，其中3人是组织核心成员，持有重型武器。”
沈慕的系统正实时解析货轮的通讯数据，突然弹出预警提示：“检测到货轮与南美某未知信号源进行加密通讯，内容经过多层伪装，初步解密显示‘已确认护航力量就位，预计三日后在预定海域汇合’。”他立刻放大信号定位图谱：“信号源来自南美秘鲁附近的海域，大概率是组织安排的护航船队，数量不明，需提前部署应对方案。”
赤井秀一立刻联系国际刑警海上支援部队：“请求调派两艘护卫舰前往秘鲁海域外围待命，一旦发现组织护航船队，先进行监视跟踪，避免打草惊蛇。待‘远航号’进入拦截预定海域后，再同步实施围堵。”国际刑警代表随即回应：“护卫舰已从智利港口出发，预计12小时内抵达指定位置，全程开启静默航行模式。”
与此同时，全球范围内组织残余势力的最后部署核查工作进入收尾阶段。欧洲刑警传来消息，已彻底清查组织在欧洲的最后一处休眠据点，抓获外围成员3名，未发现任何武装力量；非洲分部则完成了对组织隐秘武器库的清缴，销毁了大量未流入市场的枪支弹药。“所有已知的组织残余势力均已肃清，不会对本次终极拦截造成外部干扰。”沈慕将核查结果同步给拦截团队，让众人安心。
灰原哀带领技术团队，对深海矿石的特性展开紧急解析。结合从乌丸莲耶秘档中获取的资料，她快速整理出一份矿石特性报告：“这种深海矿石含有特殊的能量元素，是‘永生药剂’改良的核心原料，但稳定性极差，受到剧烈撞击或高温就会发生爆炸。”她将报告递交给拦截团队：“登船后务必避免对三号货舱进行武力攻击，建议采用麻醉武器控制守卫。”
柯南趴在桌前，反复研究“远航号”的船体结构草图，突然指出关键隐患：“货轮的动力舱与三号货舱相邻，组织极有可能在动力舱设置联动引爆装置——一旦货舱被突破，就会触发动力舱爆炸，同归于尽。”沈慕立刻让系统对船体结构进行模拟推演，果然发现动力舱与货舱之间有隐秘的线路连接痕迹：“已标记引爆装置的可能位置，安排爆破专家重点排查拆除。”
清晨时分，终极拦截团队已在指定海域的秘密基地整装待发。队员们身着特制的海上作战服，配备防水通讯器、麻醉狙击枪、水下推进器等装备。赤井秀一站在队伍前方，进行最后的战术部署：“本次行动分为三个小队：突击小队负责登船控制驾驶室，切断货轮操控权；爆破小队潜入动力舱与货舱，拆除引爆装置；掩护小队乘坐执法船在货轮周边警戒，拦截可能的护航力量。”
安室透补充道：“卧底人员会在行动开始前，将货轮的舱门密码、监控盲区位置同步给各小队。行动信号为红色信号弹，所有小队需在信号发出后三分钟内完成登船，避免给组织成员反应时间。”他举起手中的通讯器：“所有通讯频道已加密，每一分钟同步一次位置信息，若失去联系，立即按预设方案行动。”
米花市情报中心内，沈慕正与各方支援力量确认协同细节。“空中支援直升机已抵达预定空域，可随时提供空中侦察与火力支援；海上医疗船已在拦截海域外围待命，准备接收伤员；国际刑警的法律团队也已就位，待行动结束后，第一时间对查获的证据进行封存，确保司法程序合法合规。”
此时，“远航号”货轮已驶入太平洋中部海域，卧底传回紧急消息：“货轮上的组织成员开始加强戒备，正在检查货舱的安保装置，似乎察觉到了异常。”沈慕立刻通过通讯器提醒拦截团队：“提前做好行动准备，密切关注货轮动态，若组织成员提前启动应急预案，立即实施拦截，不必等待预定海域。”
赤井秀一随即下令团队登船准备：“所有小队登上执法船，向‘远航号’靠近，保持安全距离隐蔽跟随。”执法船缓缓驶离秘密基地，朝着货轮的方向前进。甲板上，队员们检查着手中的装备，眼神坚定，空气中弥漫着决战前的紧张氛围。一名年轻队员深吸一口气，赤井秀一拍了拍他的肩膀：“放心，我们的准备足够充分，正义终将胜利。”
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灰原哀将制备好的解毒剂与矿石爆炸抑制剂交给前往前线的医疗人员：“这是针对APTX4869衍生物的解毒剂，还有矿石爆炸抑制剂，若矿石发生泄漏，可快速控制险情。”她望着屏幕上的货轮画面，轻声说道：“一定要阻止他们，不能让‘永生药剂’的阴谋再次蔓延。”柯南点头：“我们会的，这是第三卷的最后一战，也是守护和平的关键一战。”
午后，“远航号”货轮即将进入拦截预定海域，组织的护航船队也已出现在雷达监测范围内，共三艘快艇，正快速向货轮靠拢。“所有小队注意，准备行动！”赤井秀一通过通讯器下达指令，队员们立刻进入战斗状态。执法船缓缓加速，朝着货轮逼近，直升机也开始在货轮上空盘旋，寻找最佳的支援位置。
沈慕在情报中心内，通过系统实时推演战局：“护航船队的火力较弱，掩护小队可快速将其拦截；突击小队从货轮左侧的监控盲区登船，这里的安保力量最薄弱；爆破小队从右侧水下潜入，直接前往动力舱。”他将推演得出的最优路线同步给各小队：“行动开始！”
红色信号弹在海面上腾空而起，划破天际。突击小队率先行动，利用绳索快速登上货轮甲板，与组织成员展开激烈交火。掩护小队的执法船朝着护航船队冲去，双方在海面上展开追逐战，子弹溅起阵阵水花。爆破小队则潜入水下，借助水下推进器，悄无声息地靠近货轮的右侧船身。
卧底人员在驾驶室内部配合行动，趁组织成员不备，用麻醉针制服了两名守卫，控制了驾驶室的操控权。“驾驶室已控制！货轮已减速！”卧底通过通讯器汇报，赤井秀一立刻下令：“突击小队前往三号货舱，控制守卫；爆破小队立即拆除引爆装置！”
米花市情报中心内，所有人都紧盯着屏幕上的战况。柯南握着侦探徽章，手心微微出汗；灰原哀双手紧握，目光紧紧锁定三号货舱的监控画面；沈慕则不断调整战术指令，为前线小队提供实时支援。屏幕上，突击小队已抵达三号货舱门口，正准备破解舱门密码；爆破小队也已潜入动力舱，开始排查引爆装置。
“护航船队已全部拦截，无人员伤亡！”掩护小队传来捷报。与此同时，爆破小队成功找到并拆除了动力舱与货舱的联动引爆装置；突击小队也破解了舱门密码，冲进三号货舱，与守卫展开最后的对峙。屏幕上，三号货舱内的深海矿石被严密包裹在特制容器中，旁边还停放着一台小型转移设备，正是组织准备转移乌丸莲耶的工具。
当突击小队控制三号货舱的消息传回情报中心时，所有人都长舒一口气。沈慕看着屏幕上被制服的组织成员，语气沉稳：“第三卷的最后一项任务已完成，终极拦截的前期行动圆满成功。”柯南露出释然的笑容：“接下来，就是第四卷的最终决战，彻底终结组织的阴谋。”
夕阳西下，金色的余晖洒在太平洋的海面上，“远航号”货轮已被执法船包围，平稳停靠在预定海域。拦截团队的队员们站在货轮甲板上，望着远方的夕阳，心中满是坚定。第三卷的帷幕在这决战前的宁静中渐渐落下，所有的铺垫与准备都已完成，一场彻底终结黑衣组织的终极对决，即将在第四卷正式上演。